Az emberiség mellett létezik egy másik faj is, az Ajin-nek, azaz féllények. 17 évvel a történet kezdete előtt jöttek rá létezésükre. Bár teljesen ugyanúgy néznek ki, mint mi – egy dologban mégis különböznek: nem képesek meghalni.
A 17 év során közel 46 egyedet sikerült azonosítani, s elfogni őket. Emberi tulajdonság a félelem és a kapzsiság, így nem is csoda, hogy évek óta kísérleteznek a befogott példányokkal.
Főhősünk Nagai Kei egy középiskolás diák. Válogatja a barátait, ismerőseit, elfoglaltságait, hogy jobb emberré válhasson, s orvos lehessen. Egyik délután azonban mindennek vége szakad. Hazafelé menet elüti egy teherautó, ám ő mégsem hal meg. Kei is egy Ajin. És ezzel kezdetét veszi a menekülés…