Élt egyszer egy híres babakészítő mester, akit Rozennek hívtak. Az volt az álma, hogy megalkossa a tökéletes lányt, Alice-t, akivel leélheti életét, ezért megalkotott egy több babából álló kollekciót, a Rozen Maiden-t. A babák mindegyikének adott Rozen Mysthica-t. Ezeket a Rozen Mysthica-kat kell a babáknak összegyűjteniük, hogy megnyerjék az Alice Game-t, s készítőjükkel együtt boldogan élhessenek. Csakhogy azóta a mester már elhunyt, s az eltelt évek óta egyik babának sincs kedve már harcolni, kivéve egyet…
Sakurada Jun egy hikkikomori, kerüli az emberek társaságát, nem jár iskolába, egyedül csak a szobája magányát élvezi. Az a hobbija, hogy különös dolgokat rendel az interneten, s a „garancia” lejárta előtt visszaküldi őket, hogy hibásak. Éppen egy túlvilági lénnyel köt üzeletet, majd nemsokára egy ládát fedez fel, amiben egy gyönyörű, élethű babát talál.
A baba neve Shinku, s ő az ötödik Rozen Maiden baba. Hamarosan egy bohóc baba érkezik az ablakon keresztül, s Shinku közli Junnal, hogy Jun hamarosan meg fog halni, hacsak nem köt vele szövetséget. Jun mivel életveszélyben van, megköti az egyezséget, s ezáltal Shinku médiuma lett.
Figyelemmel kísérhetjük kettejük életét, ahogy egyre több babával találkoznak, s talán még az Alice Game végét is megláthatjuk:)